Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms