Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTBP60709 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTBP60709 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTBP60709 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTBP60709 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTBP60709 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTBP60709 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTBP60709 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTBP60709 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTBP60709 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTBP60709 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTBP60709 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTBP60709 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTBP60709 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTBP60709 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTBP60709 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTBP60709 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTBP60709 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTBP60709 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTBP60709 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTBP60709 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTBP60709 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTBP60709 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTBP60709 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTBP60709 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTBP60709 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTBP60709 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTBP60709 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTBP60709 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms