Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVPABLB-1P60509 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms