Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIPK4P57078 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIPK4P57078 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms