Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms