Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP7P55210 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP7P55210 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP7P55210 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP7P55210 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP7P55210 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP7P55210 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP7P55210 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP7P55210 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP7P55210 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP7P55210 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP7P55210 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP7P55210 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP7P55210 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP7P55210 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP7P55210 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CASP7P55210 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CASP7P55210 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP7P55210 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP7P55210 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP7P55210 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP7P55210 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP7P55210 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP7P55210 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP7P55210 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP7P55210 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP7P55210 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP7P55210 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP7P55210 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP7P55210 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP7P55210 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP7P55210 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP7P55210 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP7P55210 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP7P55210 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP7P55210 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP7P55210 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP7P55210 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP7P55210 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP7P55210 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP7P55210 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP7P55210 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP7P55210 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP7P55210 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP7P55210 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP7P55210 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP7P55210 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP7P55210 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP7P55210 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP7P55210 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP7P55210 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP7P55210 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP7P55210 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP7P55210 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP7P55210 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP7P55210 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP7P55210 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP7P55210 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP7P55210 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP7P55210 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP7P55210 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP7P55210 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP7P55210 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP7P55210 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP7P55210 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP7P55210 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP7P55210 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP7P55210 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP7P55210 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP7P55210 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP7P55210 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP7P55210 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP7P55210 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP7P55210 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP7P55210 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP7P55210 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP7P55210 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP7P55210 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP7P55210 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP7P55210 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP7P55210 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP7P55210 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP7P55210 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP7P55210 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP7P55210 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP7P55210 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms