Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GYS2P54840 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GYS2P54840 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GYS2P54840 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GYS2P54840 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GYS2P54840 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GYS2P54840 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GYS2P54840 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GYS2P54840 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GYS2P54840 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GYS2P54840 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GYS2P54840 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GYS2P54840 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GYS2P54840 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GYS2P54840 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GYS2P54840 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GYS2P54840 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GYS2P54840 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GYS2P54840 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GYS2P54840 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GYS2P54840 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GYS2P54840 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GYS2P54840 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GYS2P54840 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GYS2P54840 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GYS2P54840 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GYS2P54840 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GYS2P54840 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GYS2P54840 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GYS2P54840 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GYS2P54840 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GYS2P54840 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GYS2P54840 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GYS2P54840 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GYS2P54840 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GYS2P54840 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GYS2P54840 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GYS2P54840 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GYS2P54840 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GYS2P54840 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GYS2P54840 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GYS2P54840 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GYS2P54840 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GYS2P54840 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GYS2P54840 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GYS2P54840 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GYS2P54840 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GYS2P54840 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GYS2P54840 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GYS2P54840 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GYS2P54840 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GYS2P54840 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GYS2P54840 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GYS2P54840 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GYS2P54840 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GYS2P54840 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GYS2P54840 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GYS2P54840 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GYS2P54840 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GYS2P54840 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GYS2P54840 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GYS2P54840 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GYS2P54840 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GYS2P54840 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GYS2P54840 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GYS2P54840 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GYS2P54840 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GYS2P54840 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GYS2P54840 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms