Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RARSP54136 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RARSP54136 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RARSP54136 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RARSP54136 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RARSP54136 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARSP54136 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARSP54136 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARSP54136 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARSP54136 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARSP54136 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARSP54136 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARSP54136 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARSP54136 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARSP54136 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARSP54136 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RARSP54136 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARSP54136 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARSP54136 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARSP54136 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARSP54136 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARSP54136 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARSP54136 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARSP54136 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARSP54136 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARSP54136 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARSP54136 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARSP54136 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARSP54136 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARSP54136 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARSP54136 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARSP54136 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARSP54136 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARSP54136 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARSP54136 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARSP54136 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARSP54136 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARSP54136 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RARSP54136 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARSP54136 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARSP54136 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARSP54136 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARSP54136 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARSP54136 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARSP54136 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARSP54136 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARSP54136 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARSP54136 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARSP54136 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARSP54136 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARSP54136 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARSP54136 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARSP54136 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARSP54136 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARSP54136 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARSP54136 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARSP54136 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARSP54136 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARSP54136 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARSP54136 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARSP54136 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RARSP54136 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RARSP54136 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RARSP54136 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RARSP54136 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RARSP54136 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RARSP54136 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RARSP54136 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RARSP54136 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RARSP54136 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RARSP54136 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RARSP54136 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RARSP54136 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RARSP54136 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RARSP54136 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RARSP54136 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RARSP54136 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARSP54136 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARSP54136 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARSP54136 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARSP54136 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARSP54136 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARSP54136 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARSP54136 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RARSP54136 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARSP54136 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARSP54136 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARSP54136 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RARSP54136 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RARSP54136 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RARSP54136 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RARSP54136 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RARSP54136 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RARSP54136 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RARSP54136 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RARSP54136 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RARSP54136 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RARSP54136 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RARSP54136 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RARSP54136 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms