Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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PGGT1BP53609 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PGGT1BP53609 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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PGGT1BP53609 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PGGT1BP53609 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
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PGGT1BP53609 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PGGT1BP53609 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PGGT1BP53609 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PGGT1BP53609 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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