Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB28P51157 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB28P51157 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB28P51157 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB28P51157 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB28P51157 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB28P51157 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB28P51157 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB28P51157 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB28P51157 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB28P51157 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB28P51157 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB28P51157 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB28P51157 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB28P51157 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB28P51157 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB28P51157 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB28P51157 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB28P51157 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB28P51157 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB28P51157 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB28P51157 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB28P51157 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB28P51157 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB28P51157 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB28P51157 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB28P51157 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB28P51157 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB28P51157 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB28P51157 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB28P51157 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB28P51157 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB28P51157 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB28P51157 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB28P51157 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB28P51157 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB28P51157 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB28P51157 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB28P51157 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB28P51157 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB28P51157 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB28P51157 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB28P51157 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms