Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5CP51148 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms