Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBP50607 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBP50607 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBP50607 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBP50607 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBP50607 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBP50607 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBP50607 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBP50607 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBP50607 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBP50607 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBP50607 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBP50607 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBP50607 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBP50607 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBP50607 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBP50607 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBP50607 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBP50607 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBP50607 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBP50607 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBP50607 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBP50607 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBP50607 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBP50607 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBP50607 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBP50607 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBP50607 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBP50607 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBP50607 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBP50607 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBP50607 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBP50607 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBP50607 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBP50607 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBP50607 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBP50607 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBP50607 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBP50607 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBP50607 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBP50607 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBP50607 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBP50607 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBP50607 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBP50607 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBP50607 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBP50607 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBP50607 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBP50607 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBP50607 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBP50607 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBP50607 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBP50607 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBP50607 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBP50607 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBP50607 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBP50607 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBP50607 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBP50607 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms