Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN1P49768 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSEN1P49768 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms