Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLCP48506 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLCP48506 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLCP48506 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLCP48506 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLCP48506 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLCP48506 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLCP48506 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLCP48506 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLCP48506 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLCP48506 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLCP48506 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLCP48506 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLCP48506 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLCP48506 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLCP48506 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLCP48506 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLCP48506 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLCP48506 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLCP48506 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLCP48506 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLCP48506 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLCP48506 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLCP48506 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLCP48506 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLCP48506 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLCP48506 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLCP48506 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLCP48506 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLCP48506 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLCP48506 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLCP48506 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLCP48506 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLCP48506 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLCP48506 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLCP48506 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLCP48506 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLCP48506 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLCP48506 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLCP48506 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLCP48506 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLCP48506 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLCP48506 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLCP48506 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLCP48506 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLCP48506 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLCP48506 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLCP48506 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLCP48506 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLCP48506 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLCP48506 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLCP48506 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLCP48506 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLCP48506 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLCP48506 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLCP48506 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLCP48506 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLCP48506 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLCP48506 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLCP48506 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCLCP48506 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCLCP48506 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCLCP48506 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GCLCP48506 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCLCP48506 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCLCP48506 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLCP48506 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLCP48506 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLCP48506 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLCP48506 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLCP48506 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLCP48506 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLCP48506 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLCP48506 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLCP48506 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLCP48506 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLCP48506 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLCP48506 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCLCP48506 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCLCP48506 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCLCP48506 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCLCP48506 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCLCP48506 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCLCP48506 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms