Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSSP48449 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSSP48449 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSSP48449 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSSP48449 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSSP48449 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSSP48449 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSSP48449 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSSP48449 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSSP48449 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSSP48449 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSSP48449 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSSP48449 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSSP48449 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSSP48449 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSSP48449 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSSP48449 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LSSP48449 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSSP48449 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSSP48449 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSSP48449 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSSP48449 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSSP48449 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSSP48449 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSSP48449 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSSP48449 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LSSP48449 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSSP48449 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSSP48449 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms