Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA4P43681 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA4P43681 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA4P43681 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA4P43681 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA4P43681 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA4P43681 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA4P43681 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA4P43681 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms