Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A4P43007 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms