Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPL35P42766 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPL35P42766 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPL35P42766 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPL35P42766 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPL35P42766 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
RPL35P42766 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPL35P42766 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPL35P42766 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms