Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CAP42336 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CAP42336 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms