Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GRIA2P42262 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA2P42262 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms