Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHKAP35790 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHKAP35790 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHKAP35790 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKAP35790 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKAP35790 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKAP35790 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKAP35790 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKAP35790 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKAP35790 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKAP35790 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKAP35790 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKAP35790 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKAP35790 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKAP35790 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHKAP35790 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHKAP35790 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKAP35790 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKAP35790 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKAP35790 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKAP35790 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKAP35790 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKAP35790 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKAP35790 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKAP35790 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKAP35790 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKAP35790 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHKAP35790 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKAP35790 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKAP35790 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKAP35790 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKAP35790 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKAP35790 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKAP35790 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKAP35790 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKAP35790 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKAP35790 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKAP35790 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHKAP35790 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHKAP35790 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHKAP35790 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHKAP35790 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHKAP35790 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHKAP35790 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHKAP35790 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHKAP35790 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHKAP35790 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHKAP35790 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKAP35790 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKAP35790 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKAP35790 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKAP35790 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKAP35790 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKAP35790 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKAP35790 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKAP35790 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKAP35790 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKAP35790 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKAP35790 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHKAP35790 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKAP35790 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKAP35790 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKAP35790 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKAP35790 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKAP35790 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKAP35790 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKAP35790 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKAP35790 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHKAP35790 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms