Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYH11P35749 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYH11P35749 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYH11P35749 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYH11P35749 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MYH11P35749 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYH11P35749 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYH11P35749 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYH11P35749 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYH11P35749 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYH11P35749 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYH11P35749 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYH11P35749 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYH11P35749 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MYH11P35749 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MYH11P35749 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYH11P35749 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYH11P35749 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYH11P35749 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYH11P35749 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYH11P35749 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYH11P35749 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYH11P35749 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYH11P35749 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYH11P35749 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYH11P35749 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYH11P35749 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYH11P35749 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYH11P35749 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MYH11P35749 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYH11P35749 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MYH11P35749 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYH11P35749 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYH11P35749 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYH11P35749 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYH11P35749 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYH11P35749 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYH11P35749 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYH11P35749 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYH11P35749 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYH11P35749 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYH11P35749 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYH11P35749 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYH11P35749 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYH11P35749 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYH11P35749 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYH11P35749 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYH11P35749 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MYH11P35749 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MYH11P35749 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms