Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK1P35558 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK1P35558 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK1P35558 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK1P35558 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK1P35558 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK1P35558 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK1P35558 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK1P35558 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK1P35558 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK1P35558 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK1P35558 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK1P35558 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK1P35558 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK1P35558 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK1P35558 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK1P35558 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK1P35558 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK1P35558 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK1P35558 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK1P35558 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK1P35558 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK1P35558 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK1P35558 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK1P35558 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK1P35558 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms