Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXD13P35453 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD13P35453 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms