Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMI1P35226 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMI1P35226 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMI1P35226 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMI1P35226 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms