Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG3P32926 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG3P32926 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG3P32926 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG3P32926 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG3P32926 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG3P32926 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSG3P32926 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG3P32926 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG3P32926 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG3P32926 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG3P32926 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG3P32926 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG3P32926 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG3P32926 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSG3P32926 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG3P32926 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG3P32926 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG3P32926 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG3P32926 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG3P32926 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG3P32926 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG3P32926 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG3P32926 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG3P32926 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG3P32926 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG3P32926 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG3P32926 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSG3P32926 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG3P32926 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG3P32926 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG3P32926 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG3P32926 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG3P32926 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG3P32926 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG3P32926 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG3P32926 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG3P32926 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG3P32926 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG3P32926 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG3P32926 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSG3P32926 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG3P32926 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG3P32926 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG3P32926 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG3P32926 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG3P32926 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG3P32926 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG3P32926 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG3P32926 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG3P32926 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG3P32926 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSG3P32926 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DSG3P32926 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG3P32926 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG3P32926 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG3P32926 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG3P32926 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG3P32926 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG3P32926 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG3P32926 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG3P32926 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG3P32926 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG3P32926 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG3P32926 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG3P32926 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG3P32926 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG3P32926 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG3P32926 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG3P32926 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG3P32926 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG3P32926 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG3P32926 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG3P32926 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG3P32926 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG3P32926 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG3P32926 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms