Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms