Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms