Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA11P31270 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXA11P31270 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms