Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-FP30511 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms