Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRB3P28472 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GABRB3P28472 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms