Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms