Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2AP24928 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms