Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF4BP23588 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms