Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA1P20827 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms