Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFE3P19532 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFE3P19532 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFE3P19532 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFE3P19532 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFE3P19532 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFE3P19532 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFE3P19532 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFE3P19532 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TFE3P19532 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFE3P19532 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFE3P19532 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFE3P19532 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFE3P19532 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFE3P19532 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFE3P19532 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFE3P19532 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFE3P19532 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TFE3P19532 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFE3P19532 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFE3P19532 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFE3P19532 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFE3P19532 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFE3P19532 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TFE3P19532 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFE3P19532 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFE3P19532 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TFE3P19532 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFE3P19532 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFE3P19532 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFE3P19532 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFE3P19532 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFE3P19532 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFE3P19532 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFE3P19532 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFE3P19532 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms