Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
TNNI3P19429 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNNI3P19429 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TNNI3P19429 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNNI3P19429 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNNI3P19429 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNNI3P19429 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNNI3P19429 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNNI3P19429 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNNI3P19429 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNNI3P19429 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms