Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD53P19397 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD53P19397 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CD53P19397 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD53P19397 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD53P19397 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD53P19397 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD53P19397 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD53P19397 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD53P19397 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD53P19397 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD53P19397 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD53P19397 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD53P19397 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD53P19397 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD53P19397 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD53P19397 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD53P19397 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD53P19397 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD53P19397 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD53P19397 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms