Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDCP19113 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDCP19113 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDCP19113 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDCP19113 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDCP19113 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDCP19113 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDCP19113 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDCP19113 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDCP19113 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDCP19113 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDCP19113 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDCP19113 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDCP19113 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDCP19113 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDCP19113 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDCP19113 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDCP19113 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDCP19113 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDCP19113 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDCP19113 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDCP19113 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDCP19113 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HDCP19113 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HDCP19113 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HDCP19113 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDCP19113 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDCP19113 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDCP19113 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDCP19113 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDCP19113 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDCP19113 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDCP19113 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDCP19113 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDCP19113 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDCP19113 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDCP19113 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDCP19113 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDCP19113 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDCP19113 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDCP19113 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDCP19113 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDCP19113 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDCP19113 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDCP19113 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDCP19113 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDCP19113 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDCP19113 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDCP19113 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDCP19113 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDCP19113 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDCP19113 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDCP19113 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDCP19113 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDCP19113 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDCP19113 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDCP19113 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDCP19113 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDCP19113 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDCP19113 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDCP19113 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDCP19113 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HDCP19113 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDCP19113 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDCP19113 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDCP19113 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HDCP19113 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDCP19113 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDCP19113 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms