Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT15P19012 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT15P19012 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT15P19012 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT15P19012 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT15P19012 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT15P19012 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT15P19012 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT15P19012 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT15P19012 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT15P19012 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT15P19012 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT15P19012 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT15P19012 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT15P19012 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT15P19012 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT15P19012 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT15P19012 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT15P19012 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT15P19012 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT15P19012 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT15P19012 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT15P19012 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT15P19012 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT15P19012 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT15P19012 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT15P19012 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms