Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR1P18146 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR1P18146 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR1P18146 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR1P18146 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR1P18146 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR1P18146 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR1P18146 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR1P18146 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR1P18146 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR1P18146 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR1P18146 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR1P18146 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR1P18146 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR1P18146 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR1P18146 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR1P18146 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR1P18146 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR1P18146 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR1P18146 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR1P18146 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR1P18146 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR1P18146 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR1P18146 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR1P18146 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR1P18146 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR1P18146 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR1P18146 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR1P18146 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR1P18146 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms