Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF7P17544 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF7P17544 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF7P17544 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF7P17544 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF7P17544 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF7P17544 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF7P17544 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF7P17544 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF7P17544 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF7P17544 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF7P17544 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF7P17544 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF7P17544 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF7P17544 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF7P17544 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF7P17544 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF7P17544 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF7P17544 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF7P17544 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF7P17544 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF7P17544 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF7P17544 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF7P17544 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF7P17544 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF7P17544 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF7P17544 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF7P17544 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF7P17544 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF7P17544 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF7P17544 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF7P17544 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF7P17544 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF7P17544 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF7P17544 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF7P17544 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF7P17544 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF7P17544 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF7P17544 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF7P17544 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF7P17544 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF7P17544 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF7P17544 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF7P17544 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF7P17544 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF7P17544 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF7P17544 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF7P17544 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF7P17544 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF7P17544 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7P17544 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7P17544 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7P17544 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7P17544 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7P17544 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7P17544 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7P17544 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7P17544 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7P17544 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7P17544 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF7P17544 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7P17544 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7P17544 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7P17544 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7P17544 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7P17544 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7P17544 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7P17544 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7P17544 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7P17544 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7P17544 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7P17544 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7P17544 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7P17544 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7P17544 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF7P17544 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7P17544 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7P17544 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7P17544 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7P17544 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF7P17544 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms