Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
UBTFP17480 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
UBTFP17480 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
UBTFP17480 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
UBTFP17480 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
UBTFP17480 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
UBTFP17480 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
UBTFP17480 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
UBTFP17480 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
UBTFP17480 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
UBTFP17480 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
UBTFP17480 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBTFP17480 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBTFP17480 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBTFP17480 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBTFP17480 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBTFP17480 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBTFP17480 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBTFP17480 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBTFP17480 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBTFP17480 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBTFP17480 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBTFP17480 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBTFP17480 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBTFP17480 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
UBTFP17480 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
UBTFP17480 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
UBTFP17480 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
UBTFP17480 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
UBTFP17480 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
UBTFP17480 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
UBTFP17480 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
UBTFP17480 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
UBTFP17480 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
UBTFP17480 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
UBTFP17480 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
UBTFP17480 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
UBTFP17480 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBTFP17480 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
UBTFP17480 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
UBTFP17480 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
UBTFP17480 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
UBTFP17480 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
UBTFP17480 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
UBTFP17480 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
UBTFP17480 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
UBTFP17480 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
UBTFP17480 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
UBTFP17480 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
UBTFP17480 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
UBTFP17480 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
UBTFP17480 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
UBTFP17480 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
UBTFP17480 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
UBTFP17480 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
UBTFP17480 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
UBTFP17480 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBTFP17480 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBTFP17480 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBTFP17480 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBTFP17480 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBTFP17480 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
UBTFP17480 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
UBTFP17480 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBTFP17480 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBTFP17480 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBTFP17480 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBTFP17480 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBTFP17480 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBTFP17480 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBTFP17480 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
UBTFP17480 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
UBTFP17480 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
UBTFP17480 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
UBTFP17480 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
UBTFP17480 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
UBTFP17480 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms