Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A2P16615 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms