Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ACADSP16219 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSP16219 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSP16219 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSP16219 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSP16219 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSP16219 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSP16219 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms