Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD44P16070 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD44P16070 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD44P16070 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD44P16070 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD44P16070 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD44P16070 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD44P16070 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD44P16070 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD44P16070 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD44P16070 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD44P16070 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD44P16070 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD44P16070 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD44P16070 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD44P16070 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD44P16070 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD44P16070 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD44P16070 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CD44P16070 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD44P16070 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD44P16070 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD44P16070 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD44P16070 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD44P16070 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD44P16070 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CD44P16070 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD44P16070 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD44P16070 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD44P16070 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD44P16070 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD44P16070 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD44P16070 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD44P16070 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD44P16070 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD44P16070 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD44P16070 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CD44P16070 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD44P16070 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD44P16070 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CD44P16070 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CD44P16070 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD44P16070 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD44P16070 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD44P16070 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD44P16070 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD44P16070 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD44P16070 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD44P16070 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD44P16070 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD44P16070 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD44P16070 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD44P16070 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD44P16070 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD44P16070 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD44P16070 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD44P16070 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD44P16070 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD44P16070 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD44P16070 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD44P16070 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD44P16070 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD44P16070 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD44P16070 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD44P16070 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD44P16070 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD44P16070 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD44P16070 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD44P16070 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD44P16070 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD44P16070 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD44P16070 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CD44P16070 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD44P16070 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CD44P16070 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD44P16070 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD44P16070 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD44P16070 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD44P16070 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD44P16070 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CD44P16070 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD44P16070 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD44P16070 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms