Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRAFP15056 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRAFP15056 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRAFP15056 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRAFP15056 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRAFP15056 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRAFP15056 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRAFP15056 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRAFP15056 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRAFP15056 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRAFP15056 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRAFP15056 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRAFP15056 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRAFP15056 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRAFP15056 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRAFP15056 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRAFP15056 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRAFP15056 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRAFP15056 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRAFP15056 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRAFP15056 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRAFP15056 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRAFP15056 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRAFP15056 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRAFP15056 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRAFP15056 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRAFP15056 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRAFP15056 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRAFP15056 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRAFP15056 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRAFP15056 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRAFP15056 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRAFP15056 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRAFP15056 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRAFP15056 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRAFP15056 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRAFP15056 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRAFP15056 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRAFP15056 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRAFP15056 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRAFP15056 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRAFP15056 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRAFP15056 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRAFP15056 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRAFP15056 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRAFP15056 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRAFP15056 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRAFP15056 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRAFP15056 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms