Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM27P14373 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRIM27P14373 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms