Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms