Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH1P12830 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH1P12830 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH1P12830 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH1P12830 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH1P12830 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH1P12830 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH1P12830 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH1P12830 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH1P12830 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH1P12830 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH1P12830 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH1P12830 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH1P12830 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH1P12830 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH1P12830 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH1P12830 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH1P12830 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH1P12830 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH1P12830 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH1P12830 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH1P12830 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH1P12830 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH1P12830 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH1P12830 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms